Sono un collaboratore tecnico con esperienza nella diagnostica microbiologica clinica (coltivazione ed isolamento di microrganismi e diagnosi di agenti infettivi con i metodi diagnostici convenzionali e molecolari); nella determinazione fenotipica e molecolare della suscettibilità ai farmaci antimicrobici; nel sequenziamento genomico per la caratterizzazione dei determinanti di resistenza antimicrobica o di virulenza.
Negli ultimi anni ho focalizzato la mia attenzione in:
1) Caratterizzazione metagenomica del microbioma in diverse nicchie ecologiche in stati di salute e condizioni patologiche;
2) Studio dei profili trascrizionali per analizzare l’interazione ospite/comunità microbica e ospite/patogeno;
3) Approccio in vitro con piattaforma in vitro SHIME, per lo studio della composizione microbica e dell’attività metabolica nella mucosa e nel lume intestinale.
Attività di Ricerca
Analisi trascrittomica di cellule tumorali, cellule staminali, organoidi, tessuti umani e murini in modelli di malattia.
Preparazione dei campioni e delle librerie per sequenziamento di nuova generazione (bulk, single‑cell, small e non‑coding RNA).
Profilazione trascrittomica di batteri e studi trascrittomici ospite-patogeno.
Studio del microbioma nella comparsa di malattie complesse.
Studio delle interazioni microbiota‑ospite-esposoma e dell'impatto dei metaboliti microbici sulla fisiologia e sul rischio di malattia.
