Sono un ricercatore senior con una formazione in biologia molecolare e un master e un dottorato di ricerca conseguiti presso il Politecnico federale di Zurigo (ETHZ). Da oltre 20 anni conduco ricerche nel campo della bioinformatica e della biologia computazionale. Il mio principale interesse è lo studio della regolazione genica a livello di trascrizione (metilazione del DNA) e di silenziamento genico post-trascrizionale (miRNA). I piccoli RNA sono coinvolti anche nella difesa delle piante dai patogeni e, pertanto, mi sono occupato anche di studi sulle interazioni tra piante e virus. Mi occupo inoltre di analisi dei dati RNA-seq, assemblaggio di genomi di alta qualità , vari tipi di polimorfismo genomico e creazione del pan-genoma. I miei risultati principali sono stati ottenuti su piante quali Arabidopsis, manioca (Manihot esculenta), igname (Dioscorea rotundata) e mais (Zea mays).
Attività di Ricerca
Assemblaggio di genomi ad alta risoluzione, risolti per aplotipo, e caratterizzazione del polimorfismo.
Profilazione trascrittomica per biomarcatori di RNA codificanti e non‑codificanti e analisi di pathway regolatori.
Sviluppo, applicazione e ottimizzazione di pipeline automatizzate per l'analisi di dati genomici, epigenomici e trascrittomici per studi su larga scala.
