Le mie attività di ricerca correnti sono centrate sull’analisi e l’integrazione di dati biologici generati con tecnologie high-throughput (RNA-seq bulk e single-cell, WES, WGS) e sequenziamento long-read Nanopore per applicazioni genomiche e trascrittomiche. Sviluppo ed integro pipeline computazionali per l’analisi di questi dati, con applicazioni in malattie autoimmuni, rare e oncologiche, e lavoro al miglioramento delle strategie di interpretazione delle varianti genetiche e dell’espressione genica attraverso interazioni molecolari e pathway biologici
Attività di Ricerca
Analisi basate su sequenziamento long‑read in studi genomici (isoforme trascrizionali, splicing complesso, varianti strutturali).
Analisi trascrittomica di cellule tumorali, cellule staminali, organoidi, tessuti umani e murini in modelli di malattia.
Analisi basate su long‑read sequencing per studi trascrittomici.
Sviluppo, applicazione e ottimizzazione di pipeline automatizzate per l'analisi di dati genomici, epigenomici e trascrittomici per studi su larga scala.
Implementazione e applicazione di pipeline di analisi automatizzate per l'analisi di dati di trascrittomica di massa, single-cell e spaziali.
