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Questo progetto è guidato dalla "Comunità" di Proteomica ELIXIR in collaborazione con i membri della comunità di metabolomica e tre piattaforme ELIXIR. La proteomica ad alto rendimento è diventata una scelta popolare negli studi biologici, biomedici e clinici e ha portato allo sviluppo di centinaia di strumenti bioinformatici e pipeline di analisi dei dati. Data la loro ampia diversità, vi è un'urgente necessità di confrontare e confrontare diverse pipeline software su un ampio spettro di dati. Questo studio mira a creare il framework per confrontare i flussi di lavoro di analisi dei dati di proteomica, da sviluppare e migliorare con le risorse delle piattaforme ELIXIR Tool, Data e Compute, creando un'interfaccia tra loro collegata con dati di proteomica pubblici e software e pipeline stand-alone open source. I dati coinvolti saranno annotati con almeno le informazioni minime EOSC secondo gli standard dei metadati ELIXIR. Il nostro benchmarking identificherà flussi di lavoro solidi e quindi alimenterà la comunità della proteomica con gli elevati standard qualitativi richiesti per una ricerca riproducibile e applicazioni cliniche.