Sono ricercatore dell'ITB-CNR dal 2006 e attualmente coordino il gruppo di Proteomica Clinica Computazionale.
Negli ultimi 15 anni, la mia ricerca si è concentrata sulle scienze omiche, in particolare sulla proteomica, e sulla biologia dei sistemi, utilizzando la teoria dei grafi e modelli di rete che includono interazioni proteina-proteina, co-espressione, segnaling e miRNAs-Targets. Questi approcci sono stati applicati in modo trasversale sia in campo biomedico che nello studio di virus, microrganismi e piante. In particolare, sono stati utilizzati per comprendere i meccanismi molecolari alla base di diverse patologie e per monitorarne l'efficacia terapeutica. In questo contesto, le malattie cardiovascolari, amiloidosi, polmonari e tumorali sono tra gli argomenti più frequentemente trattati. Altrettanto significativo è il numero di studi incentrati sulla comprensione del sistema immunitario.
Le mie attività di ricerca e sviluppo sono state svolte parallelamente a periodi di visita presso istituzioni di ricerca pubbliche e private internazionali, tra cui il Center for Complex Network Research (CCNR) presso la Northeastern University (Boston, USA), l'EMBL-EBI (Cambridge, Regno Unito), lo Scripps Research Institute (San Diego, USA) e la North Carolina State University (Kannapolis, USA).
Attività di Ricerca
Analisi proteomica attraverso spettrometria di massa ad alta risoluzione e cromatografia micro/nano‑fluidica.
Analisi computazionale e sviluppo di pipeline per la caratterizzazione qualitativa e quantitativa del proteoma, inclusa l'analisi di rete all'interno di un approccio di biologia dei sistemi.
Sviluppo di metodologie innovative nella medicina di rete, sfruttando reti e percorsi molecolari per l'analisi integrata dei dati
Integrazione multiomica per identificare vie regolatorie, moduli genici, reti proteiche e segnali compositi associati a fenotipi patologici.
Sviluppo di modelli di interattoma umano e modelli nulli per l'analisi basata sulla rete.
