Progetto

NORA

NORA: a sequencing-based approach to define NucleOid stRuctural Alterations in Helicobacter pylori dormancy

Referente Scientifico ITB

Titolo

NORA: a sequencing-based approach to define NucleOid stRuctural Alterations in Helicobacter pylori dormancy

Acronimo

NORA

Sede

Segrate

Data di inizio

2023

Data di fine

2026

Ente finanziatore

MUR

Enti partecipanti esterni

UniBO: Elena Chiti, Davide Roncarati, Andrea Vannini

La comprensione dei meccanismi che regolano la struttura del nucleoide batterico definendone la funzionalità trascrizionale è ancora agli albori, ma potrebbe essere di grande rilevanza epidemiologica. Ipotizziamo infatti che la regolazione della struttura del nucleoide sia alla base dei processi che regolano la transizione da forme batteriche vitali a forme coccoidi dormienti, resistenti agli antibiotici ma riattivabili in determinate condizioni. Per questo ci proponiamo di caratterizzare le alterazioni dell’accessibilità del nucleoide di H.pylori, classificato come carcinogeno di classe I per il tumore gastico, in molteplici condizioni di crescita incluso il coccoide, con la tecnologia 4f-SAMMY-seq. Questo progetto fornirà alla comunità scientifica il primo adattamento di questa tecnologia ai batteri, rendendo possibile il suo utilizzo anche in altre specie, e la prima caratterizzazione delle variazioni della struttura del nucleoide di H pylori nelle diverse fasi di crescita corredata con dati trascrizionali. Per questo motivo costituirà il primo passo poter comprendere i meccanismi che ne regolano la conformazione del nucleoide.