Sono una ricercatrice bioinformatica con una solida formazione in Biotecnologie (Laurea Magistrale) e in Medicina Molecolare e Traslazionale (Dottorato di Ricerca). La mia ricerca si concentra sullo studio della fisiologia batterica e dei suoi effetti sulle dinamiche ospite-microbiota, in stati di salute e malattia, nel tempo, e nell'ambito di interventi nutrizionali. Dal 2021 lavoro nell'ambito della ricerca sul microbioma, con una vasta esperienza nell'analisi dei dati di sequenziamento di nuova generazione (NGS), dall'elaborazione dei dati grezzi alle interpretazioni biologiche dei risultati. Ho una buona conoscenza di R e sviluppo regolarmente script e pipeline personalizzati utilizzando strumenti come QIIME, dada2, phyloseq e PICRUSt2. Durante un periodo di ricerca al MSKCC di New York, sotto la guida del dott. Joao Xavier, ho applicato tecniche di apprendimento automatico a grandi set di dati sul microbioma umano per supportare lo sviluppo di strategie di trapianto di microbiota fecale (FMT) come trattamento del cancro. Sono inoltre formato per l'utilizzo di un approccio in vitro (piattaforma SHIME) per la valutazione della composizione microbica e dell'attività metabolica in sezioni gastrointestinali mucose e luminali.
Attività di Ricerca
Studio del microbioma nella comparsa di malattie complesse.
Studio delle interazioni microbiota‑ospite-esposoma e dell'impatto dei metaboliti microbici sulla fisiologia e sul rischio di malattia.
Studio del microbioma animale e alimentare per sicurezza, conservazione della biodiversità e miglioramento delle performance animali.
Sviluppo, applicazione e ottimizzazione di pipeline automatizzate per l'analisi di dati genomici, epigenomici e trascrittomici per studi su larga scala.
Gestione e armonizzazione dei dati biomedici attraverso l'organizzazione, la cura e l'integrazione di set di dati eterogenei di salute e ricerca in formati standardizzati.
