Sono un ricercatore nel campo delle tecnologie "-omiche" e della bioinformatica. Durante la mia esperienza lavorativa presso l'ITB-CNR, mi sono occupato dell'analisi bioinformatica di dati genomici e trascrittomici provenienti da numerosi progetti; dopo aver trascorso i primi 6 anni applicando le mie competenze a dati derivati ​​da microarray, dal 2008 ho iniziato a lavorare su dati di sequenziamento , su piattaforme Roche e Illumina e, più recentemente, sulla tecnologia Oxford Nanopore a long-read. In particolare, ho partecipato all'analisi dei dati di diversi progetti volti alla caratterizzazione della diversità batterica in ecosistemi complessi, come il microbiota umano e animale. Inoltre, partecipo attivamente alla caratterizzazione di riarrangiamenti genomici e trascrittomici complessi nei tumori (geni di fusione, trascritti, circRNA, neocentromeri, dmin-HSR). Ho acquisito una profonda conoscenza dei principali strumenti bioinformatici per la profilazione tassonomica e funzionale dei dati dei microbiota e per la rilevazione di riarrangiamenti cromosomici, nonché di software statistici (ad esempio: Matlab), sistemi operativi Unix-like e linguaggio Perl, e sono in grado di implementare pipeline personalizzate per analisi bioinformatiche.
Le mie attuali collaborazioni scientifiche includono diversi colleghi dell'ITB-CNR, nonché di altri Istituti del CNR (ad esempio: IBBA, ISPA, STIIMA) e di Istituzioni esterne (ASST Vimercate, Policlinico di Milano, Università di Bologna, Università degli Studi di Milano, Università di Pavia).
Attività di Ricerca
Implementazione e applicazione di pipeline di analisi automatizzate per l'analisi di dati di trascrittomica di massa, single-cell e spaziali.
Valutazione dell'efficacia di un programma di intervento sullo stile di vita per migliorare le prestazioni metaboliche, cognitive e/o funzionali.
